Sistem WCS bertanggungjawab untuk penjadualan antara sistem dan peralatan, dan menghantar arahan yang dikeluarkan oleh sistem WMS kepada setiap peralatan untuk operasi yang diselaraskan. Terdapat komunikasi berterusan antara peralatan dan sistem WCS. Apabila peralatan menyelesaikan tugas, sistem WCS secara automatik melaksanakan pengeposan data dengan sistem WMS.